个人简介
李宏博,博士,教授,博士生导师,1995年出生于山东泰安,祖籍山东省鄄城县。先后于山东农业大学园艺学院和中国农业科学院蔬菜花卉研究所获学士和硕士学位,2024年获荷兰瓦赫宁根大学博士学位,导师为中国科学院院士黄三文研究员和荷兰皇家科学与人文学会院士Richard Visser教授。担任Nature Genetics, Genome Biology, Plant Physiology期刊审稿人。邮箱:lihongbo_solab@163.com
李宏博博士建立了茄科和葫芦科蔬菜作物的比较基因组学研究体系,构建了黄瓜、野生番茄和马铃薯的泛基因组,利用泛基因组图谱挖掘了调控产量、开花时间和抗性等农艺性状的重要基因和关键变异,为近缘野生种质资源在作物遗传改良中的应用提供了组学研究思路。在Nature, Cell, Nature Genetics, Nature Communications, Nature Plants, SCIENCE CHINA Life Sciences等期刊发表论文17篇,总被引1000余次。其中以第一或通讯作者(含共同)在Nature (2022), Nature Genetics (2023), Nature Communications (2022), SCIENCE CHINALife Sciences (2023)等期刊发表论文8篇。部分研究成果入选ESI高被引论文,被Faculty Opinions(原F1000 Prime)推荐,被Nature, Science, Cell, Nature Review Genetics等期刊引用,并被Nature, Nature Genetics等期刊高亮点评。
教学工作
讲授博士生课程《园艺生物信息学》。
研究方向
课题组计划以番茄和马铃薯为研究对象,利用基因组学、生物信息学、遗传学、分子生物学等多学科整合研究策略,鉴定并召回栽培作物中“丢失”的遗传变异,阐释驯化对不同作物野生种基因组改良的共有内在规律,解析抗性等重要性状形成的遗传基础,开发高效利用近缘野生种的基因组学方法论,以指导野生种质资源在作物育种中的应用。
招生情况
课题组每年招收1名博士生和1–3名硕士生。
代表性论文
Li, H.#, Wang, S.#, Chai, S., Yang, Z., Zhang, Q., Xin, H., Xu, Y., Lin, S., Chen, X., Yao, Z., Yang, Q., Fei, Z., Huang, S., and Zhang, Z.* (2022). Graph-based pan-genome reveals structural and sequence variations related to agronomic traits and domestication in cucumber. Nat. Commun. 13, 682. 10.1038/s41467-022-28362-0.
Tang, D.#, Jia, Y.#, Zhang, J.#, Li, H.#, Cheng, L., Wang, P., Bao, Z., Liu, Z., Feng, S., Zhu, X., Li, D., Zhu, G., Wang, H., Zhou, Y., Zhou, Y., Bryan, G.J., Buell, C.R., Zhang, C., and Huang, S.* (2022). Genome evolution and diversity of wild and cultivated potatoes. Nature 606, 535-541. 10.1038/s41586-022-04822-x. (# 共同第一作者)
Li, N.#, He, Q.#, Wang, J., Wang, B., Zhao, J., Huang, S., Yang, T., Tang, Y., Yang, S., Aisimutuola, P., Xu, R., Hu, J., Jia, C., Ma, K., Li, Z., Jiang, F., Gao, J., Lan, H., Zhou, Y., Zhang, X., Huang, S., Fei, Z., Wang, H.*, Li, H.*, and Yu, Q.* (2023). Super-pangenome analyses highlight genomic diversity and structural variation across wild and cultivated tomato species. Nat. Genet. 55, 852-860. 10.1038/s41588-023-01340-y. (* 共同通讯作者)
Li, H., Yang, X., Shang, Y., Zhang, Z., and Huang, S.* (2023). Vegetable biology and breeding in the genomics era. Sci. China Life Sci. 66, 226-250. 10.1007/s11427-022-2248-6.
Li, H., et al. Genomic basis of divergence of modern cultivated potatoes. Preprint at Research Square. https://www.researchsquare.com/article/rs-3968149/v1
Li, H., Brouwer, M., Pup, E.D., van Lieshout, N., Finkers, R., Bachem, C.W.B., and Visser, R.G.F.* (2024). Allelic variation in the autotetraploid potato: genes involved in starch and steroidal glycoalkaloid metabolism as a case study. BMC Genomics 25, 274. 10.1186/s12864-024-10186-5.
Li, Q.#, Li, H.#, Huang, W.#, Xu, Y., Zhou, Q., Wang, S., Ruan, J., Huang, S., and Zhang, Z.* (2019). A chromosome-scale genome assembly of cucumber (Cucumis sativus L.). GigaScience 8, giz072. 10.1093/gigascience/giz072. (# 共同第一作者)
Wang, S.#*, Li, H.#, Li, Y., Li, Z., Qi, J., Lin, T., Yang, X., Zhang, Z., and Huang, S. (2020). FLOWERING LOCUS T improves cucumber adaptation to higher latitudes. Plant Physiol. 182, 908-918. 10.1104/pp.19.01215. (# 共同第一作者)
Chen, X. #, Li, H. #, Dong, Y. #, Xu, Y., Xu, K., Zhang, Q., Yao, Z., Yu, Q., Zhang, H., and Zhang, Z. (2024). A wild melon reference genome provides novel insights into the domestication of a key gene responsible for melon fruit acidity. Theor. Appl. Genet. 137, 144. 10.1007/s00122-024-04647-4. (# 共同第一作者)
奖励
山东省青年科技人才托举工程(SDAST2024QTA030)
2023年中国农业科学重大进展论文
2019年硕士研究生国家奖学金
国家留学基金管理委员会公派出国留学资格
第十九届全国植物基因组学大会墙报一等奖
第七届国际园艺研究大会墙报一等奖
中国农业科学院第二届研究生三分钟论文演讲比赛一等奖
2017届山东农业大学优秀学士学位论文
2017届山东农业大学优秀毕业生